CoRTecS

Detail

The core facility

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Biologie cellulaire, Imagerie, Biologie moléculaire, Biochimie, Génomique, Biologie systémique, Développement, Biologie structurale Plateforme de Protéomique et Spectrométrie de Masse IGBMC

  • Head Manager of the core facility Frédéric DARDEL
  • Scientifical Manager Laszlo TORA
  • Technical Manager Luc NEGRONI
  • UMR 7104 / UMR_S 1258 - IGBMC / Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire
  • CNRS, INSERM, UNIVERSITE DE STRASBOURG
  • Ilkirch-Graffenstaden
  • Monosite
  • Service delivery
    • to the academic community
  • Collaborations of research
    • with the academic community
    • to the socio-economic world
  • Affiliated institution of administrative supervision
    • CNRS
    • INSERM
    • UNIVERSITE DE STRASBOURG
PPSMI

La Plateforme Protéomique de l’IGBMC est ouverte à l'ensemble de la communauté scientifique pour des prestations de service, des prestations de recherche et des collaborations. Dotée de deux spectromètres de masses et de l'informatique associé, elle réalise des analyses protéomiques; identification et quantification de protéines dans des mélanges simples ou complexes (protéine purifiée, IP, extrait cellulaire, tissus, etc), caractérisation de modifications Post-traductionnelles, déterminations de masse entière, analyse de complexes protéiques.

Access website

Core facility documents

Expertises

Scientific expertise

  • Protéomique quantitative
  • Spectrométrie de masse
  • Fragmentations ETD
  • Modifications Post-traductionnelles
  • Ubiquitinilation
  • Phosphorylation
  • Acetylation
  • N-glycosylation
  • Ponts disulfures
  • Crosslinks
  • Masses exactes

Technical expertise

  • Protéomique quantitative
  • Spectrométrie de masse
  • Fragmentations ETD
  • Modifications Post-traductionnelles
  • Ubiquitinilation
  • Phosphorylation
  • Acetylation
  • N-glycosylation
  • Ponts disulfures
  • Crosslinks
  • Masses exactes

Resources

Main equipments

  • NanoLC - Orbitrap Elite (Thermo Scientific)
  • MicroLC - QTOF Xevo XS (Waters)
  • HPLC semi préparative (Thermo Scientific)
  • NanoLC - FAIMS - Exploris 480 (Thermo Scientific)
  • Synthétiseur de peptides ABI 433A (Applied Biosystem)
  • HPLC preparative (Waters)

Other kinds of rooms

  • Laboratoire de préparation (Hottes - Thermomixers - incubateurs - SpeedVaacs)
  • Laboratoire Mass Spec. (Hottes - spectrometres de masses - paillasses)
  • Laboratoire HPLC (HPLC + collecteur de fractions)

Software resources / Data bases

  • Proteome Discoverer (Thermo Scientific)
  • MaxQuant + Perseus (Jürgen Cox Lab, Max Planck Institute of Biochemistry)
  • Skyline (MAcCoss Lab, University of Washington)

Other kinds of resources

  • Serveurs de calcul et stockage (2)
  • NAS 16 To

Examples of service delivery

  • Digestion liquide
  • Digestion en gel
  • NanoLC- MS/MS (analyse protéomique bottom-up)
  • MicroLC-MS ( proteine & petite molécules)
  • Analyse statistique et bio-informatique

Recent collaborative projects