CoRTecS

informatique Graphique, Analyse de données et Intelligence Artificielle

La plateforme

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Sciences et technologies de l'information et de la communication - STIC informatique Graphique, Analyse de données et Intelligence Artificielle

  • Directeur-trice scientifique David CAZIER
  • Directeur-trice technique Jean REHBINDER
  • UMR 7357 - ICUBE / Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie
  • CNRS, UNIVERSITE DE STRASBOURG
  • Ilkirch-Graffenstaden
  • Distribuée
  • Prestations de services
    • à la communauté académique
    • au monde socio-économique
  • Collaborations de recherche
    • avec la communauté académique
    • avec le monde socio-économique
  • Tutelles de rattachement
    • CNRS
    • UNIVERSITE DE STRASBOURG
GAIA

La plateforme GAIA rassemble les expertises des ingénieurs du laboratoire ICube dans le domaine de l’informatique, du calcul scientifique et de l’intelligence artificielle, afin de proposer une offre de services complète sur les différents aspects de la science des données (numérisation, gestion des données, traitement et analyse, modélisation et simulation, visualisation et interactions) en soutien à des projets de recherche et/ou de valorisation en lien avec des partenaires académiques ou issus du monde socio-économique.

Accéder au site web

Expertises

Expertise scientifique

  • Sciences des données
  • Intelligence artificielle
  • Réalité virtuelle
  • Informatique graphique
  • Modélisation et simulation

Expertise technique

  • Numérisation 3D
  • Gestion des données
  • Analyse et traitement des données (signal, image)
  • Modélisation et simulation
  • Visualisation et interactions
  • Développement logiciel
  • Infrastructure de calcul et de stockage

Ressources

Principaux équipements

  • Dispositifs immersif de réalité virtuelle (Cave de réalité virtuelle, workbench bi-écran 200cm, mur immersif 400cm, système à retour d'effort, système de tracking infra-rouge)
  • Dispositifs d'acquisition et de numérisation 3D (LiDAR, Scanner à lumière structurée, appareils photo numériques)
  • Périphériques d'interaction pour la réalité virtuelle (casques, combinaison de données, eye tracker, capteurs, ... )

Ressources logicielles / bases de données

  • ExRealis : logiciel de reconstruction de scène 3D à partir de nuage de points et de photo numérique
  • CGoGN : librairie de modélisation géométrique et topologique multidimensionnelle (surface, volume, maillage)
  • ASTex : librairie de génération de texture
  • SOFA : framework de simulation physique temps réel (https://www.sofa-framework.org/)
  • EASEA : plate-forme logicielle pour algorithmes évolutionnaires massivement parallèle (easea.unistra.fr)
  • FoDoMuST: Fouille de données Multi-Stratégie Multi-Temporelles (https://sdc.icube.unistra.fr/en/index.php/FODOMUST)

Exemples de prestations de service

  • Numérisation 3D d’objets ou de bâtiments
  • Collecte, gestion et fairification de données
  • Traitement et analyses de données (numériques, signaux, images,...)
  • Conception de modèles et algorithmes pour des applications en géométrie, animation ou simulation spécifiques
  • Développement de méthodes et outils personnalisés de réalité virtuelle

Projets collaboratifs récents

Partenariats de la plateforme

  • Analyse moléculaire & chimique
    • Séquençage & génomique
      • Séquenceurs NGS (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore...)
      • Séquenceurs Sanger
      • Robot de préparation de librairies
    • Transcriptomique & protéomique
      • RT-qPCR
      • Digital PCR
      • Plateforme Nanostring
      • Spectrométrie de masse (LC-MS/MS, MALDI-TOF...)
    • Chimie analytique
      • Chromatographie (HPLC, UHPLC, GC)
      • Couplages LC-MS, GC-MS
      • Résonance magnétique nucléaire (RMN)
      • Spectroscopie (UV-Vis, IR, Raman, fluorescence)
  • Biologie cellulaire & culture
    • Culture cellulaire
      • Salles stériles L2 / L3
      • Hottes à flux laminaire
      • Incubateurs CO₂
      • Bioréacteurs / Cell culture spinner
      • Systèmes microfluidiques
    • Cytométrie & tri cellulaire
      • Cytomètres en flux
      • Tri cellulaire FACS
      • Cytométrie de masse (CyTOF)
      • Analyse single-cell (Chromium 10x, etc.)
    • Outils de manipulation génétique
      • Électroporateurs / transfection
      • Systèmes CRISPR/Cas9 automatisés
      • Robots pipeteurs
  • Imagerie & microscopie
    • Microscopie optique
      • Microscope confocal
      • Microscope à fluorescence
      • Microscope à feuille de lumière (light-sheet)
      • Microscope multiphotonique
      • Microscope super-résolution (STED, PALM, STORM...)
    • Microscopie électronique & corrélative
      • Microscope électronique à transmission (TEM)
      • Microscope électronique à balayage (SEM)
      • Cryo-microscopie électronique (Cryo-EM)
      • Tomographie électronique
      • Microscopie corrélative lumière/électron(CLEM)
      • Zeiss Supra 40 + elphy+
    • Imagerie in vivo & préclinique
      • Imagerie par résonance magnétique (IRM) préclinique
      • Imagerie TEP/TDM (PET/CT, SPECT)
      • Imagerie bioluminescence / fluorescence in vivo
      • Échographie haute résolution
  • Informatique, calcul & plateformes numériques
    • Clusters de calcul haute performance (HPC)
    • Stockage sécurisé de données (LIMS, cloud scientifique)
    • Stations de traitement d’images et d’IA
    • Logiciels de bio-informatique & data science
  • Instrumentation biomédicale & physiologie
    • Systèmes d’électrophysiologie (patch-clamp, MEA)
    • EEG/ECG/EMG précliniques
    • Systèmes de métabolisme cellulaire (Seahorse)
    • Spectrométrie de flux métabolique
  • Logistique & équipements généraux de plateformes
    • Salles froides, chambres climatiques
    • Congélateurs -80°C, azote liquide
    • Robots de logistique d’échantillons
    • Automates de lavage de plaques
    • Balance de précision, pH-mètres, spectrophotomètres de base
  • Matériaux, physique & ingénierie
    • Microscopie à force atomique (AFM)
      • Dimension Edge 150
    • Diffraction des rayons X (XRD)
    • Diffusion des rayons X aux petits angles (SAXS)
    • Lithographie et nanofabrication
      • Litho laser Heidelberg µPG101
      • Gravure Ionique Réactive Plasmalab80plus
    • Imprimantes 3D (bio-impression, polymères, métaux)
    • Spectroscopie de photoélectrons induits par rayons X
    • spectroscopie de photoélectrons induits par rayons X
    • PHI GENESIS
    • Spectroscopie de photoélectrons induits par rayons X
    • ThermoVGMultilabESCA3000
    • VSW5000
    • ThermoVGMicrotech
    • PHI GENESIS: c'est un système UHV de dernière génération qui intègre une architecture entièrement automatisée pour l’acquisition, l’alignement et la calibration, tout en offrant des capacités de micro-analyse et de cartographie avancées.
    • VSW5000 : système XPS (sources X double Mg/Al et Al monochromatique) et des analyses de surface avancées (UPS He I/He II, abrasion ionique Ar⁺, LEIS, des mesures angulaires jusqu’à 80° et des mesures quasi in-situ).
    • Thermo VG Multilab ESCA3000 : est un système XPS équipé d’une source X double Mg/Al, dédié à l’analyse de grandes séries d’échantillons (jusqu’à 6 échantillons simultanément).
    • Thermo VG Microtech : système XPS/UPS permettant des analyses de surface sur une large gamme de températures (−170 à 1200 °C). Spectromètre de masse et système de dosage de gaz pour la TDS. Source de dépôt de métaux.
  • Préparation & manipulation d’échantillons
    • Cryostats, microtomes
    • Automates de coloration / immunohistochimie
    • Robots de préparation d’ADN/ARN
    • Lyophilisateurs, homogénéisateurs
    • Centrifugeuses (ultracentrifuge, microcentrifuge)
  • Zootechnie, phénotypage & comportement animal
    • Hébergement & élevage
      • Animaleries rongeurs
      • Animaleries poisson-zèbre
      • Animaleries moustiques
      • Animaleries faune sauvage
    • Phénotypage & comportement
      • Cages métaboliques
      • Tapis roulants, rotarod, open-field
      • Systèmes de suivi vidéo (tracking comportemental)
      • Tests nociceptifs
      • Tests anxio-dépressifs
      • Tests cognitifs
      • Modèles de douleurs aigues et chroniques
      • Modèles de troubles anxiodépressifs
      • Modèles de troubles neurodéveloppementaux
      • Tests moteurs
      • Tests des comportements sociaux
      • Chirurgie Stéréotaxique
      • Administrations de molécules par différentes voies
      • Stimulation Optogénétique in vivo et photmétrie de Fibre
    • Imagerie animale spécifique
      • Micro-IRM
      • Micro-CT
      • Échographie rongeur