BSI - FRISBI

Plateforme de Biologie Structurale Intégrée - FRISBI
Domaine Biologie cellulaire, Imagerie, Biologie moléculaire, Biochimie, Génomique, Biologie systémique, Développement, Biologie structurale

La plateforme

  • Directeur-trice scientifique
    Bruno KLAHOLZ
  • Directeur-trice technique
    Catherine BIRCK
  • UMR 7104 / UMR_S 1258 - IGBMC / Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire
  • CNRS, INSERM, UNIVERSITE DE STRASBOURG
  • Ilkirch-Graffenstaden
  • Monosite
  • Prestations de services
    • à la communauté académique
    • au monde socio-économique
  • Collaborations de recherche
    • avec la communauté académique
    • au monde socio-économique

Missions

La plateforme de Biologie Structurale Intégrée de l'IGBMC/CBI offre aux utilisateurs les expertises et technologies pour la production d'échantillons (protéines et macromolécules biologiques), leur caractérisation biophysique jusqu'à la détermination de leur structure tridimensionnelle grâce à différentes approches qui sont la cryo-microscopie électronique, la cristallographie aux rayons X, la diffusion des rayons X, la microscopie super résolution et la RMN. L'ensemble de ces technologies permet d'offrir aux utilisateurs une approche intégrée pour la détermination de structures.
La plateforme a aussi une mission de formation par l'accueil des utilisateurs sur site et par l'organisation d'ateliers pratiques.

Expertises

Expertise scientifique

  • Détermination de structure 3D de protéines et complexes macromoléculaires
  • Production et purification de protéines
  • Caractérisation biophysique de macromolécules
  • Cristallisation de macromolécules
  • Intégration de données multi-échelles

Expertise technique

  • Cryo-microscopie électronique
  • Cristallographie aux rayons X
  • Production de protéines en cellules d'insectes/système baculovirus
  • Purification de protéines
  • Cristallisation
  • Ultracentrifugation analytique
  • SEC-MALS
  • Microscopie super résolution
  • RMN

Ressources

Principaux équipements

  • Cryo microscope électronique Titan Krios G4 avec E-CFEG, Selectris X, Falcon 4i
  • Cryo microscope electronique Titan Krios equippé avec des cameras K3/Falcon3, GIF et Volta Phase Plate
  • Cryo microscope électronique Glacios
  • Microscope électronique cryo-FIB-SEM
  • Microscope électronique Tecnai F20
  • Générateur de rayons X FRX couplé avec un détecteur Pilatus 300K et un BioSAXS-1000
  • Spectromètres RMN, 600MHz et 700MHz avec cryo-sondes
  • Robots de cristallisation Mosquito et systèmes de visualisation Rock Imager
  • Microscope super-résolution Leica SR GSD
  • Chameleon : Système de congélation automatique de grilles pour cryo microscopie électronique
  • Ultracentrifugeuse analytique XL-I
  • Fermenteurs de 30L et 100L
  • Vitrobot et Plama Cleaner pour la préparation de grilles ME
  • Ultramicrotome et système de congélation haute pression HPF
  • Système de nanoDSF Prometheus NT.48
  • Système de thermophorèse Monolith NT.115

Locaux spécifiques

  • Laboratoire L1
  • Laboratoire L2

Autres locaux

  • Salles équipées pour cultures de cellules mammifères niveau L2
  • Salles équipées pour cultures de cellules d'insectes/système baculovirus niveau L2
  • Chambres froides pour la purification de protéines et la cristalisation
  • Pièces à 20°C et 27°C pour la cristallisation de protéines

Ressources logicielles / bases de données

  • Serial EM; EPU; Warp; CryoSparc;Topspin (Bruker); Autoproc; Buster; CCP4 suite; Chimera; Coot; Dials; HKL2000; HKL3000; Phenix Suite; Pymol; Shelx; Solve; XDS

Autres types de ressources

  • Souches bactériennes, cellules d'insectes et de mammifères.
  • Vecteurs d'expression procaryotes et eucaryotes.
  • Différentes colonnes chromatographiques.

Exemples de prestations de service

  • Enregistrement d'images par cryo-microscopie électronique sur Titan Krios
  • Cribblage par cryo-microscopie électronique sur Glacios et sur Tecnai F20 (coloration négative)
  • Réalisation de gouttes de cristallisation avec robot Mosquito
  • Enregistrement de données de diffraction RX sur cristaux
  • Production de protéines en cellules d'insectes/système baculovirus et en cellules mammifères
  • Enregistrement de données par RMN
  • Purification de protéines et complexes protéiques
  • Caractérisation biophysique de protéines (AUC, ITC, SEC-MALS, DLS, nanoDSF, MST)
  • Production bactérienne en erlen et fermenteur
  • Analyse par microscopie GSD hyper-résolution

Partenaires récents

Projets collaboratifs récents

RAR-scale

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Détermination des bases structurales de la reconnaissance de l'ADN et du contrôle allostérique par les récepteurs nucléaires RXR-RAR (Osz et al., 2020)

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HiChemSynPro

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Projet visant à développer de nouveaux outils pour la synthèse chimique de bibliothèques de protéines. Les nouvelles approches comprennent des protéines catalytiques conçues de novo et des réacteurs microfluidiques.

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Etude par cryo-microscopie électronique d'un supercomplexe de la chaîne respiratoire bactérienne

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