GENOMAX

GENOMAX
Domaine Biologie cellulaire, Imagerie, Biologie moléculaire, Biochimie, Génomique, Biologie systémique, Développement, Biologie structurale

La plateforme

  • Directeur-trice scientifique
    Raphael CARAPITO
  • Directeur-trice technique
    Anne MOLITOR
  • UMR_S 1109 - IRM / Immunorhumatologie moléculaire
  • INSERM, UNIVERSITE DE STRASBOURG
  • Hôpital civil
  • Monosite
  • Prestations de services
    • au monde socio-économique
  • Collaborations de recherche
    • avec la communauté académique
    • au monde socio-économique

Certifications et accréditations

Exome Certification

Expertises

Expertise scientifique

  • Associations génotype/phénotype
  • Analyses génétiques familiales
  • Immunogénétique
  • Analyses génétiques en cohortes pour des pathologies multi-géniques
  • Analyses de génomes/exomes somatiques
  • Profils transcriptionnels sur différents tissus (homme et souris)
  • Analyses de données multi-dimensionnelles
  • Analyses de la variabilité génomiques de virus et de bactéries

Expertise technique

  • Génome
  • Exome
  • RNAseq
  • Single-cell RNAseq
  • Séquencage ciblé à façon
  • Deep sequencing (cancer)
  • Méta-génomique
  • Multi-omics

Ressources

Principaux équipements

  • Séquenceur Illumina NextSeq500
  • Séquenceur ThermoFisher Scientific ION S5
  • Séquenceur ThermoFisher Scientific ION Proton
  • Séquenceur ThermoFisher Scientific ION PGM
  • Covaris S220
  • Agilent Bionalayzer
  • Séquenceur 16 capillaires 3130xl (ThermoFisher Scientific)
  • Séquenceur 96 capillaires 3730xl (ThermoFisher Scientific)
  • Chromium Connect (10X genomics)

Ressources logicielles / bases de données

  • Pipelines d'analyses pour génome, exome, RNAseq, métagénomique
  • Basespace on-site (Illumina)
  • Ingenuity IPA (Qiagen)
  • HGMD (Human Gene Mutation Database)

Exemples de prestations de service

  • Séquencage d'exome
  • Séquencage de génome humain
  • Transcriptome par RNAseq