Missions
Basée à l’IBMC, la plateforme PPSE réalise les analyses protéomiques des équipes de recherche des unités partenaires du campus de l’Esplanade (IBMC UPR9022, IBMC UPR9002 IBMC UPR3572, IBMP UPR2357, GMGM UMR7156) mais également d’autres laboratoires académiques ou privés.
L'application phare de la plateforme est la caractérisation d’interactomes protéiques par spectrométrie de masse, enrichis préalablement par purification d’affinité. L'originalité de l'expertise PPSE consiste à maitriser l'ensemble de la séquence expérimentale, de l’extraction protéique et purification d’affinité à l’analyse par spectrométrie de masse. L'équipe d'ingénieurs propose de réaliser pour les chercheurs du "sur mesure" pour chaque projet d'interaction, adaptant les techniques de lyse en fonction du matériel de départ (organes de souris, insectes, cellules humaines, cellules d'insecte, plante -racines, feuilles, fleurs, bactéries, levures, etc.). Chaque étape a été optimisée pour garantir fluidité et reproductibilité expérimentale. Ce savoir-faire est indispensable pour identifier et quantifier avec succès des différentiels d’interaction protéique ou différentiel d’expression protéique. L'analyse bio-informatique finale, également à façon, permet de faire parler les données pour la valorisation des travaux de recherche.
