Détail

La plateforme
Soutenir les équipes de recherche internes et externes, de l'académique comme du privé, en proposant des outils d'acquisition, de traitement et d'analyse d'images de pointe ainsi qu'en dispensant des formations théoriques et pratiques dans les différents domaines de l'imagerie biomédicale.
Expertises
Expertise scientifique
- Biologie cellulaire
- Traitement et analyse d'images
- Neurosciences
- Cancérologie
- Immunologie, infection, inflammation
- Biomatériaux
- Médecine régénérative
- Métabolisme
- Trafic membranaire
- F-techniques (FRAP, FRET, FLIM)
Expertise technique
- Microscopie confocal mono et multiphoton
- Spinning-disk
- Vidéomicroscopie
- Microscopie champ large
- Stéréomicroscopie
- F-techniques (FRAP, FRET, FLIM)
- Microscopie super-résolutive
- Traitement et analyse d'images
- Microscope à résolution améliorée Airyscan
- Microscopie champ large apotome
- Préparation d'échantillons
Ressources
Principaux équipements
- Microscope confocal spinning-disk Olympus Ixplore Spin
- Microscope inversé confocal à résolution améliorée Zeiss LSM 800 airyscan
- Microscope inversé confocal multiphoton Leica SP5 AOBS MP
- Microscope droit champ large Zeiss Axio Imager M2 Apotome
- Microscope inversé champ large time-lapse Zeiss Observer Z1
- Microscope droit champ large Leica DM 750
- Stéréomicroscope Zeiss Discovery V20
- Stéréomicroscope Leica M651
- Station de traitement et d'analyse d'images avec Imaris et freewares (ImageJ/Fiji, Ilastik, Qupath, cellpose, stardist)
- Scanner de lames Evident VS200
Ressources logicielles / bases de données
- Logiciel Imaris de Bitplane
- Freewares conventionnels (ImageJ/FIji, ICY, Cell profiler)
- Freewares/librairies basés sur le machine/deep learning (Cellpose, Stardist, Yolo, QuPath, Ilastik)
Exemples de prestations de service
- Microscopie champ large
- Microscopie confocale (Mono et multiphoton, spinning-disk, résolution améliorée de type AiryScan)
- Traitement et analyse d'images
- Scanner de lames, brightfield et fluorescence du 2x au 60x