CoRTecS

Détail

La plateforme

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Biologie cellulaire, Imagerie, Biologie moléculaire, Biochimie, Génomique, Biologie systémique, Développement, Biologie structurale Light Microscopy Facility (Imaging Centre of the IGBMC)

  • Réseau de plateformes Réseau d'Imagerie de Strasbourg et Grand Est

  • Directeur-trice de la plateforme Juliette GODIN
  • Directeur-trice scientifique Juliette GODIN
  • Directeur-trice technique Elvire GUIOT
  • UMR 7104 / UMR_S 1258 - IGBMC / Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire
  • CNRS, INSERM, UNIVERSITE DE STRASBOURG, GIE-CERBM
  • Ilkirch-Graffenstaden
  • Monosite
  • Prestations de services
    • à la communauté académique
    • au monde socio-économique
  • Collaborations de recherche
    • avec la communauté académique
    • avec le monde socio-économique
  • Tutelles de rattachement
    • CNRS
    • INSERM
    • UNIVERSITE DE STRASBOURG
    • GIE-CERBM
ICI

Une approche d'imagerie multi-échelle, de la molécule à l'animal entier, grâce à sa large gamme de systèmes optiques avancés, commerciaux et sur mesure :
- confocal à balayage laser et "spinning disk" pour FRAP, FRET, photomanipulation et photo-ablation
- multiphoton pour l'imagerie intra vitale et l'imagerie de grands échantillons
- feuille de lumière pour l'imagerie in vivo
- Live-SR pour la microscopie à super résolution
- microscopie corrélative lumière-électron (CLEM)
- développement technologique avec des systèmes optiques sur mesure.
- Formation et assistance des utilisateurs réalisées par une équipe d'experts. Tous les utilisateurs reçoivent une formation approfondie pour utiliser le(s) microscope(s) de manière autonome. L'équipe d'experts est dédiée à fournir un haut niveau de support et de conseils depuis les protocoles de préparation des échantillons jusqu'aux étapes finales de traitement et d'analyse des images grâce à la formation pluridisciplinaire des ingénieurs du centre en physique/optique, biologie cellulaire, chimie, informatique et traitement d'images. Formation au traitement et à l'analyse quantitative des bio-images. -Enseignement et éducation. La plateforme est partenaire du programme d'enseignement de la Faculté de Pharmacie, de l'Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg (Université de Strasbourg), de l'Université de Strasbourg et de Télécom Strasbourg pour les programmes de licence, de master et de doctorat.

Accéder au site web

Expertises

Expertise scientifique

  • Biologie du développement
  • Biologie cellulaire
  • Neurosciences
  • Techniques avancées de microscopie
  • Automatisation
  • Ingénierie optique

Expertise technique

  • Imagerie du vivant
  • FRAP
  • Imagerie par feuillet de lumière (lightsheet)
  • Multi-photon
  • Transparisation (sample clearing)
  • Traitement et analyse d'image
  • Écriture de script (python, macroFiji,...)
  • FRET
  • Ingénierie optique
  • Impression 3D

Ressources

Principaux équipements

  • 5x Confocal microscope (8 systems including 2 Multi-photon lasers)
  • 2x Spinning disk confocal for photo-manipulation (FRAP, photo-ablation) and TIRF imaging
  • 1x Lightsheet microscope
  • 4x widefield microscope (fluorescence and transmitted light)
  • 2x live imaging widefield microscopes (fluorescence and transmitted light)
  • 2x macroscopes (fluorescence and transmitted light)
  • 4x image processing and analysis workstation
  • 1x Optical Sectioning in Widefield Fluorescence Microscopy
  • 1X Optical Sectioning in Widefield Fluorescence Microscopy

Locaux spécifiques

  • Laboratoire L2

Autres locaux

  • Laboratoire de préparation d'échantillon
  • Traitement et analyse d'image
  • Acquisition microscopique et macroscopique

Ressources logicielles / bases de données

  • Fiji, Cellprofiler, ImageJ, Icy, Python, Imaris, napari, jupyter Notebook

Réseau de plateformes

Exemples de prestations de service

  • Acquisition d'image microscopique et macroscopique
  • Traitement et analyse d'image
  • Préparation et optimisation des échantillons